本片改编自花泽健吾的同名漫画，讲述了曾经辉煌一时的日本忍者，在战后被GHQ遣散组织而消散，不过，他们潜伏在世界的所有机关，当代也暗中活动着，听说人数约为20万人。但基层忍者常常找不到工作，其中之一的云隐九郎（山崎贤人 饰）从属忍者组织“NIN”的末端忍者（下忍），过着与啃老族无异的生活。一天，闲得发慌的他被判了一项重大的“忍务”，那就是调查战后70多年来不停潜入地下的某个组织的动向，其名为——“地下忍者”。忍术、智谋、最新科技等驱使了统统，从未有过的战斗如今开始「讲授视频」
